確定申告ソフト複数拠点(SOHO+店舗)の按分機能で選ぶ5選

SOHOと実店舗を併用する個人事業主や小規模法人にとって、確定申告は一般的な事業形態よりも複雑な課題を抱えています。SOHOの家賃按分、店舗の光熱費、固定資産の管理など、拠点が増えるごとに経理業務は一気に複雑化するものです。

多くの場合、一般的な会計ソフトでは、拠点ごとの按分比率設定や損益管理に柔軟に対応できないケースが散見されます。結果として、手作業での計算やExcelでの別途管理が必要となり、時間と労力がか奪われるだけでなく、入力ミスや計上漏れのリスクを高めてしまいます。

本記事では、SOHOと実店舗といった複数拠点事業の特殊要件を満たす会計ソフトを、「機能・スペック」という客観的指標で徹底比較し、あなたに最適なソフトの選び方を提示します。複雑な経理業務から解放され、事業成長に集中するためのヒントがここにあります。

なぜ複数拠点事業には「専用の機能」を持つ会計ソフトが必要なのか？
【比較基準】複数拠点向け確定申告ソフト 5つの必須チェック機能
【機能徹底比較】複数拠点事業におすすめの確定申告ソフト3選
事業タイプ別シミュレーション：あなたに最適なソフトはこれだ
まとめ：最適なソフトで経理を自動化し、事業成長に集中しよう

なぜ複数拠点事業には「専用の機能」を持つ会計ソフトが必要なのか？

複数拠点を運営する事業者が、なぜ一般的な会計ソフトではなく、特定の機能を備えたソフトを選ぶべきなのか。その理由は、以下の3点に集約されます。

理由1：手計算はミスの元。拠点ごとに異なる家賃・光熱費の按分比率を自動計算する必要があるため。

SOHOの家賃や光熱費は、事業用とプライベート用の按分が必要です。さらに、実店舗の光熱費や通信費も、複数の事業を兼ねている場合は按分が必要になることがあります。これらの按分比率は、費目や拠点、利用状況によって異なり、手計算では膨大な手間とミスが生じるリスクが高まります。専用機能を持つソフトであれば、拠点ごと、費目ごとに異なる按分比率を一度設定するだけで、自動的に正確な計算が行われ、経理処理の効率化と正確性向上に貢献します。

理由2：経営判断の精度向上。拠点ごとの収支を明確にする「部門別損益計算」が不可欠なため。

SOHOと実店舗、あるいは複数の店舗を運営している場合、それぞれの拠点がどれだけの利益を生み出しているのかを把握することは、的確な経営判断を下す上で極めて重要です。部門別損益計算機能があれば、拠点ごとの売上、費用、利益をリアルタイムで可視化できます。これにより、不採算部門の早期発見や、成長部門への投資判断など、データに基づいた戦略的な意思決定が可能になります。

理由3：税務調査への備え。固定資産がどの拠点の資産かを明確に管理し、減価償却を正しく行う必要があるため。

事業用の固定資産（店舗の設備、SOHOで使用する高額PCなど）は、その取得価額や耐用年数に基づいて減価償却費を計上する必要があります。複数拠点の場合、どの資産がどの拠点に属するのかを明確に管理し、それぞれに合った減価償却計算を行うことが求められます。税務調査では、固定資産の適切な管理と減価償却の正確性が厳しくチェックされるため、これを自動化・可視化できる会計ソフトは、税務リスクを軽減する上で不可欠です。

【比較基準】複数拠点向け確定申告ソフト 5つの必須チェック機能

複数拠点事業者が会計ソフトを選ぶ際に、特に注目すべき5つの必須チェック機能を解説します。

機能① 部門別管理機能：拠点ごとの損益をリアルタイムで可視化できるか？

最も重要な機能の一つです。SOHO、店舗A、店舗Bといった形で、それぞれの拠点を「部門」として設定し、売上や経費を部門ごとに紐づけて入力できるかを確認しましょう。これにより、各拠点の収支状況をリアルタイムで把握し、経営戦略に活かすことができます。多階層での部門設定や、部門別レポートの出力機能があると、さらに便利です。

機能② 柔軟な経費按分設定：拠点ごと・費目ごとに異なる按分比率を複数設定できるか？

家賃、光熱費、通信費など、共通経費を複数の拠点や事業で按分する際に、その比率を柔軟に設定できるかが重要です。例えば、「SOHOの家賃は事業利用率50%、店舗Aの光熱費は事業利用率100%」といった具合に、費目や拠点ごとに異なる比率を複数登録し、自動で計算・仕訳してくれる機能が理想的です。

機能③ 固定資産管理機能：資産を拠点に紐づけて登録・減価償却できるか？

高額な設備や内装費など、固定資産の管理も複数拠点では複雑化します。どの固定資産がどの拠点に帰属するのかをソフト内で明確に紐づけて登録でき、それぞれの減価償却計算を自動で行ってくれる機能は必須です。償却方法の選択肢（定額法、定率法など）や、減価償却費の自動仕訳機能も確認しましょう。

機能④ クラウド対応とデータ連携：複数拠点から同時アクセス可能か？銀行口座やPOSレジと連携できるか？

クラウド型の会計ソフトであれば、SOHO、店舗、外出先など、場所を選ばずに複数拠点から同時にアクセスし、経理業務を進めることができます。また、銀行口座、クレジットカード、POSレジ、ECサイトなどとのデータ連携機能は、仕訳の自動化を強力に推進し、入力の手間とミスを大幅に削減します。特に、POSレジからの売上データ自動取り込みは、店舗経営において非常に有効です。

機能⑤ サポート体制：複雑な設定で困った際に、専門的な回答を得られるサポートがあるか？

複数拠点事業の経理は専門性が高いため、ソフトの初期設定や運用中に不明点が生じることも少なくありません。チャット、メール、電話、あるいは税理士紹介など、どのようなサポート体制が用意されているかを確認しましょう。特に、会計や税務に関する専門的な質問にも対応できるサポートがあるかどうかが、安心してソフトを使い続ける上で重要です。

【機能徹底比較】複数拠点事業におすすめの確定申告ソフト3選

ここでは、上記5つの必須チェック機能に基づき、複数拠点事業におすすめの主要会計ソフト3社を徹底比較します。

機能/ソフト名	マネーフォワードクラウド確定申告	freee会計	弥生会計オンライン
部門別管理	◎ (多階層設定、リアルタイム分析)	〇 (シンプル、タグ活用)	◎ (詳細設定、部門別レポート)
按分設定の柔軟性	◎ (費目・拠点ごと、複数比率設定)	〇 (直感的、ガイドあり)	◎ (細やかな設定、個別対応)
固定資産管理	〇 (拠点紐付け、減価償却対応)	〇 (簡易的、自動計算)	◎ (詳細な登録・償却、履歴管理)
データ連携	◎ (API豊富、POS・銀行・クレカ・EC連携)	◎ (銀行・クレカ・POS・EC連携)	〇 (銀行・クレカ連携)
サポート	〇 (チャット、メール、FAQ)	〇 (チャット、メール、FAQ)	◎ (電話、画面共有、税理士紹介)
月額料金（個人/法人）	個人: 800円〜 / 法人: 3,980円〜	個人: 980円〜 / 法人: 2,680円〜	個人: 880円〜 / 法人: 2,980円〜

マネーフォワードクラウド確定申告：部門別管理と豊富なAPI連携が強み

マネーフォワードクラウド確定申告は、複数事業・複数拠点の損益管理に非常に強い会計ソフトです。多階層の部門設定が可能で、各拠点の収支をリアルタイムで詳細に分析できます。銀行口座、クレジットカード、POSレジ、各種ECサイトなどとのAPI連携が豊富で、仕訳の自動化による効率化を最大限に図りたい事業者に最適です。

freee会計：直感的なUIで按分設定が簡単。簿記初心者でも複数拠点の経理を自動化しやすい

freee会計は、簿記の知識がない方でも直感的に操作できるUIが特徴です。複数拠点の経費按分設定もガイドに沿って簡単に行え、自動仕訳機能が強力なため、経理の手間を極限まで減らしたい事業者に適しています。クラウド連携も充実しており、どこからでもアクセス可能です。

弥生会計オンライン：堅牢な機能と手厚いサポート体制が魅力。固定資産管理の詳細設定にも対応。

弥生会計は、長年の実績に裏打ちされた堅牢な会計機能を持ち、特に固定資産管理においては詳細な設定や履歴管理が可能です。複数拠点の資産を厳密に管理したい場合に強みを発揮します。また、電話や画面共有による手厚いサポート体制は、複雑な経理処理で困った際に心強い存在となります。

事業タイプ別シミュレーション：あなたに最適なソフトはこれだ

あなたの事業形態に合わせた最適な会計ソフト選びをシミュレーションしてみましょう。

ケース1【SOHO(Web制作)＋店舗(カフェ)】→ リアルタイムの部門別損益を重視するなら「マネーフォワード」

Web制作のSOHO事業とカフェ店舗という、異なる収益構造を持つ事業を運営している場合、それぞれの事業がどれだけ利益を出しているかをリアルタイムで把握することが重要です。マネーフォワードクラウド確定申告は、多階層の部門別管理機能が充実しており、両事業の収益性を明確に可視化できます。豊富なAPI連携で、カフェのPOSデータやWeb制作の売上も自動で取り込み、効率的な経営分析が可能です。

ケース2【自宅サロン＋レンタルスペース】→ 経理の手間を極限まで減らしたいなら「freee会計」

自宅サロンとレンタルスペースの運営を兼ねている場合、共通経費の按分や、それぞれの売上管理をいかにシンプルにするかがカギとなります。freee会計は、直感的なUIと強力な自動仕訳機能により、経理業務にかかる時間を大幅に削減できます。按分設定も分かりやすく、簿記の知識が少なくてもスムーズに運用できるため、「経理はなるべく時間をかけたくない」という方に最適です。

ケース3【自宅兼事務所＋在庫を持つ実店舗】→ 資産管理を厳密に行い、電話サポートも欲しいなら「弥生会計」

自宅を兼ねた事務所と、在庫を抱える実店舗を運営している場合、PCや店舗設備などの固定資産管理、そして在庫管理が重要になります。弥生会計オンラインは、堅牢な固定資産管理機能により、詳細な資産情報を拠点に紐づけて登録し、正確な減価償却計算が可能です。また、電話や画面共有による手厚いサポートは、複雑な税務処理やソフトの操作で迷った際に、安心して相談できる大きなメリットとなります。